Кафедра физического воспитания и спорта ИГУ была организована приказом № 124 от 4 мая 1948 в результате реорганизации существующей на тот момент кафедры военного воспитания и физической подготовки (на основании приказа Министерства высшего образования СССР № 83/т от 17.П.1948г.). В те послевоенные годы не было ни одного вида спорта, где бы спортсмены Иркутского университета не входили в число лучших. Иркутские студенты участвовали на чемпионатах СССР, РСФСР и зонах Сибири и Дальнего Востока по конькобежному спорту (В.П. Яровой, А. Тузова, Г.Н. Зорина), легкой атлетике (З.В. Шилова, И.Н. Ермолаев, И.А. Кринберг, Л.А. Кузнецова), настольному теннису и волейболу (Л.А. Саклешина, Т.М. Хижаева, Г.З. Иванова-Селява, В.И. Сажин и др.).
С 1948 года по 1956 год кафедрой физического воспитания и спорта руководил почетный гражданин города Брно (ЧССР) В.В. Селява, награжденный многими правительственными наградами за боевые заслуги на фронтах Отечественной войны. Вместе с ним работали преподаватели П. Криулина, Н. Яхно и К. Шапров. В эти годы в университете активно развиваются туризм и зимние виды спорта. Тогда, несмотря на сложности и трудности, походы на вершину Хамар-Дабана привлекали многих лыжников и горнолыжников ИГУ. Так, в феврале 1950 года на вершину впервые поднялись студенты В. Ланин, Ю. Вакулин, А. Матиенко и заведующий кафедрой В.В. Селява. Проводятся первые соревнования ИГУ по скоростному спуску, набирает обороты и секция по хоккею с шайбой, проводятся вело- и лыжные пробеги вплоть до Монголии. 29 мая 1954 год проводится I легкоатлетическая эстафета на первенство университета «За научные кадры». В этот период проходят Первенство ДСО «Буревестник» по конькобежному спорту, первенство университета по фехтованию, тяжелой и легкой атлетике, спортивной гимнастике, настольному теннису, шахматам, волейболу, баскетболу.
С 1956 года по 1984 год заведующим кафедрой становится Б.В. Трифонов. В те 60-е годы в коллектив пришли сегодняшние ветераны В.И. Бонько, В.М. Сергеева, А.И. Давыдова, В.А. Фаворский, П.А. Ануфриенко и др. На тот момент перед кафедрой стояла задача развить у студентов физические качества, способствующие укреплению здоровья, и на этой основе овладеть нормативными требованиями Всесоюзного комплекса ГТО (IV ступени). С 1959 года совершенствуется учебный процесс по физическому воспитанию – с одноразовых занятий в неделю университет переходит на двухразовые. В то время на кафедре было два спортивных зала: гимнастический (административный корпус), где занимались специальные медицинские группы и сборные команды по гимнастике, и обычный – для сборных команд по боксу и тяжелой атлетике. Студенты ИГУ тренировались и на арендуемых спортивных площадках стадиона «Авангард», ныне стадион «Труд». Здесь же проводились первенства и Спартакиады университета и чемпионаты и Спартакиады областного Совета ДСО «Буревестник». Студенты с большим энтузиазмом занимались спортом и принимали самое активное участие в спортивных праздниках.
В 70-х-90-х годах студенты ИГУ продолжили спортивные традиции на первенстве Иркутской области, Универсиаде Сибири и Дальнего Востока и республик Средней Азии, ЦС «Буревестник», чемпионатах РСФСР. Это мастер спорта по настольному теннису, чемпион РСФСР А.И. Смирнов; старший тренер области по настольному теннису, заслуженный тренер РСФСР, награжден правительственной наградой «За доблестный труд» и медалью за заслуги перед Иркутской областью И.К. Зусман; мастер спорта по боксу А.И. Эдельман; кандидаты в мастера спорта по боксу А.В. Татаринов, Г.В. Аргучинцев; кандидаты в мастера спорта по шахматам В.И. Глебец, О.В. Кузьмин, С.А. Депчинский, В.В. Крон (мастер спорта международного класса – чемпион мира среди железнодорожников по переписке); мастера спорта по легкой атлетике Т.И. Бонько, О.В. Дурынина; кандидаты в мастера спорта по баскетболу В.И. Дмитриев, Г.Н. Борисов, О.Л. Косинский, А.С. Меркулов, И.В. Дмитриев и др. Команда баскетболистов университета с приходом Ильи Дмитриева впервые выигрывает чемпионат Иркутской области.
В 1978 году в университете проводится первая Спартакиада среди сотрудников и ППС по шести видам спорта: легкоатлетической эстафете, шахматам, волейболу, баскетболу, пулевой стрельбе, лыжам. Проводятся «Дни здоровья».
В 1989 году создан клуб любителей китайской гимнастики, в который с удовольствием ходили и студенты, и преподаватели. Возросло и количество видов спорта, к существующим добавились: спортивная аэробика, стрельба из лука, силовое троеборье, мини-футбол, армрестлинг, единоборства, спелеология, горный туризм, велоспорт, велотуризм.
Традицию высоких спортивных достижений 90-х годов продолжили: заслуженный мастер спорта и мастер спорта международного класса по стрельбе из пневматического пистолета Г.Н. Корзун, многократная чемпионка СССР, чемпионка и рекордсменка мира, Европы; мастер спорта международного класса по прыжкам с шестом А. Крупский, неоднократный чемпион СССР, чемпион Европы, в прошлом председатель Комитета по физической культуре и спорту администрации Иркутской области, а ныне директор Школы высшего спортивного мастерства.
С 1984 года кафедру возглавил доцент В.И. Бонько, а с 1999 по 2020 гг.– кандидат педагогических наук, профессор, Заслуженный работник физической культуры Российской Федерации, мастер спорта Р.Ф. Проходовская.
С целью оптимизации внутренней структуры университета и решения Ученого совета приказом № 588 от 24.12.2013 г. кафедра физического воспитания и спорта преобразована в Физкультурно-оздоровительный центр.
С 2020 по 2022гг. - заведующим ФОЦ был В.П. Чергинец - кандидат педагогических наук, доцент, Отличник физической культуры.
С марта 2022г. исполняющей обязанности заведующего кафедрой ФОЦ была назначена И.И. Плотникова - кандидат педагогических наук, доцент, Отличник физической культуры.
За столь долгий период существования кафедры ее коллектив постоянно обновляется. Многие сотрудники отдали ей и студентам свои знания и опыт, они внесли огромный вклад в воспитание и укрепление здоровья многих поколений университетских студентов.